Nende katalüütilises tsentris on oluline aminohappejääk tsüsteiin ning nad lõikavad märklaudvalgu aminohappeahelat aspartaadijäägi järel. Kaspaasid toodetakse inaktiivsete eellasvalkudena - prokaspaasidena, ning need aktiveeritakse vastusena apoptoosi indutseerivatele signaalidele.