Mesilaste vaenlased on imetajad, (hiired, rotid, nugised, siilid, karud). Imetajatest vaenlaste etteotsa paigutab mesinik ja mesilaste haiguste spetsialist Arnold Päev oma raamatus „Mesilaste haigused ja kahjurid” Tallinn, 1945, esikohale inimese. Lindudest kahjustavad mesilasi tihased, kärbsenäpid, suitsupääsukesed, linavästrikud, aed-lepalinnud, rähnid, pajuharakad ja toonekured. Roomajatest kahjustavad mesilasi nastikud ja kivisisalikud. Kahepaiksetest söövad mesilasi rohukonn ja harilik kärnkonn. Putukatest kahjustavad mesilasi teised röövivad mesilased. Sipelgatest on metsastel aladel mesilasi kahjustanud laanekuklased ja ka teised sipelgad, keda Eesis esineb 14 liiki. Suve teisel poolel on tarus tavaliseks külaliseks kõrvahark. Putukatest tuleb mesilaste vaenlastena veel mainida herilasi, vapsikuid, mesilashunti, villimardikat, taskumardikat, nahanäkki, suurt ja väikest vahakoid, mesilastäid. Lestadest on suuremad mesilaste kahjustajad trahhealest (Acarapis Woodi) ja varroalest Varroa Destructor.
