Nakkushaigused jagatakse kaheks suureks rühmaks: a) haudmehaigused ja b) täiskasvanud mesilaste haigused. Haigustekitajateks võivad olla bakterid, batsillid, seened ja viirused. Tuntumad haudme nakkushaigused on: euroopa haudmemädanik (vanemas kirjanduses ka healoomuline haudmemädanik või healoomuline mädapojahaigus); Ameerika haudmemädanik (e pahaloomuline haudmemädanik); lubihaue; kivihaue, kotthaue; viiruslik halvatustõbi, millesse nakatub nii haue kui ka noored mesilased. Täiskasvanud mesilaste nakkushaigusteks on septiseemia e veremürgitus; melanoos, millesse haigestub mesilasema; nosematoos; amöbiaas; APV viirus; DWV viirus ja mitmed parasitaarhaigused nagu akarapidoos ja varroatoos.
