Protonotari ametinimetust on kasutatud eelkõige Konstantinoopoli oikumeenilises patriarhaadis, kus seda kannab kõrgeim patriarhi sekretäridest. Roomakatoliku kirikus on samuti olemas protonotarid, kuid seal nimetatakse neid apostlikeks protonotariteks ja neil on teistsugused ülesanded.