Apostlik prefekt juhib apostlikku prefektuuri, enamasti misjonialadel moodustatud kiriklikku haldusüksust, kus pole veel piiskopkonna jaoks piisaval arvul usklikke ja kogudusi. Seetõttu on apostlik prefekt ka enamasti preester, mitte piiskop, kuigi väga harva on sellesse ametisse nimetatud ka titulaarpiiskoppe. Apostlik prefekt allub otse paavstile ja administratiivselt on tal piiskopiga sarnased volitused, kuid puuduvad piiskopiseisusega kaasnevad liturgilised ja sakramentaalsed õigused, juhul kui ta ei ole piiskop.
