Patogeenne toime avaldub parasiidi toitumisel, mehaanilise kahjustusena, toksilise toimena, allergiseeriva toimena, allergiliste granuloomide tekkena, inokuleeriva toimena jne. Parasitooside patogenees on alati seotud parasiidi mitme patogeense toime samaaegse mõjuga peremehesse. See on keerukas dünaamiline, üksteisele järgnevatest reaktsioonidest koosnev protsess. Parasitoosid ei kahjusta ainult üksikelundeid, nad on üldhaigused, mis häirivad peremehe kogu elutegevust.