Pärismaise ehk indigeense kiriku mõiste on kasutusel eelkõige nüüdisaegses misjoniteoorias, kus seda kasutatakse misjonikiriku vastandina. Pärismaine kirik tekib juhul, kui misjonärid ei sekku kohalike kirikustruktuuride, vaimsuse ja liturgia arengusse ega püüa neid vormida oma kultuuriruumist pärinevate arusaamade kohaselt. Vahel võib pärismaine kirik tekkida ka kohaliku elanikkonna sihiliku vastureaktsioonina misjonäride koloniseerivale tegevusele.