Koguduste liit kirikukorraldusliku vormina on eelkõige levinud vabakoguduste seas, kus iga kogudus moodustab iseseisva terviku, kuid samas on osaduses teiste sama usutunnistuse kogudustega. Tegevuse koordineerimiseks ja suuremate eesmärkide saavutamiseks ühinevad need kogudused sageli koguduste liitudeks, mis tegutsevad enamasti territoriaalsetel alustel (mingi riigi, regiooni või haldusüksuse piires). Eestis tegutsevad nt Eesti Evangeeliumi Kristlaste ja Baptistide Koguduste Liit (EEKBL) ning Eesti Evangeelsete ja Vabakoguduste Liit (EEVL), aga ka Eesti Vanausuliste Koguduste Liit (EVKL).