Ioniseerimise meetodeid on massispektromeetrias kasutusel mitmeid, Kõige tavalisem neist on elektronionisatsioon st ioniseerimine elektronidega pommitamise teel.
Elektronionisatsioonil on mitmeid eeliseid teiste ionisatsioonimeetodite ees – ta on lihtne ja odav ning annab ioone suure saagisega, mistõttu avastamispiirid on madalad. Selle ionisatsioonimeetodi puuduseks on aga see, et elektronide löögi toimel tekkivad molekulaarioonid on väga kõrge energiaga ja kipuvad ulatuslikult fragmenteeruma.
