Stigmatiinide kongregatsiooni asutas 1816. aastal Veronas preester Gaspare Bertoni (1777–1853, pühakuks kuulutatud 1989), ametliku heakskiidu andis sellele 1855. aastal paavst Pius IX (ametis 1846–1878). Bertoni soovis tagada jesuiitliku vaimsuse ja ideaalide edasikestmise olukorras, kus jesuiitide ordu püsimajäämine oli ebakindel (nende tegevus oli 1773–1814 peatatud). Ta võttis uue kongregatsiooni aluseks jesuiitide ordureeglid ning pidas samuti tähtsaks misjonit ja tegevust haridusvaldkonnas. Nime said nad sellest, et uus kongregatsioon pühendas ennast eriliselt Jeesuse ristihaavade ehk stigmade austamisele. Ühenduse ametlik nimi on Meie Issanda Jeesuse Kristuse Pühade Stigmade Kongregatsioon (ladina keeles Congregatio a Sanctissimis Stigmatibus Domini Nostri Iesu Christi, lühend CSS). Nüüdisajal tegutsevad stigmatiinid neljal mandril, nende peakorter asub Roomas.
