Kunagisele elutegevusele viitav orgaaniline ühend (nt kivimis, settes, mineraalis, kivistises). Nt mitmesuguste isotoopide (nt süsiniku, väävli, lämmastiku, fosfaatiooni, hapniku) suhted viitavad elutegevusele. Enamik traditsioonilisi biomarkereid on aga lipiidide ühendid, mis (võrreldes nukleiinhapete, aminohapete ja süsivesinikega) on võrdlemisi vastupidavad (bio)lagunemisele. Biomarkerite abil on kindlaks tehtud, et elu Maal oli olemas vähemalt 3,8 Ga tagasi; samuti on nad potensiaalsed infoallikad orgaanilise ainese bioloogilise päritolu kohta, võimalike metaboolsete teede kohta, ka tekkimise, settimise ja mattumise füüsikalis-keemiliste tingimuste kohta. Biomarkereid kasutatakse laialdaselt naftauuringutes.