Lühikese ubikvitiinide ahela seostumine kindlatele lüsiinidele on märgiks, et konkreetne valk kuulub lagundamisele tsütoplasmas olevates proteasoomides. Mõnede lüsiinide mono- või polüubikvitinüleerimine reguleerivad hoopis selliseid protsesse nagu endosoomide liikumine, põletik, mRNA translatsioon või DNA parandamine.