Kasutavad ATP hüdrolüüsi energiat prootonite transpordiks lüsosoomidesse ja vakuoolidesse nende organellide sisekeskonna hapustamiseks. Transportvalkude fosforüülumist ei toimu. Võimaldavad teiste ühendite ja ioonide sekundaaraktiivset transporti nendesse organellidesse prootongradiendis peituva energia kasutamisel.