Parasitoloogia jagatakse uuritavate parasiitide süstemaatilise kuuluvuse alusel tavaliselt neljaks osaks: protozooloogia, helmintoloogia, akroloogia ja entomoloogia. Parasiitide peremehi arvestades jagatakse parasitoloogia taimeparasitoloogiaks, loomaparasitoloogiaks ja inimese- ehk meditsiiniliseks parasitoloogiaks.
