USB-mikroskoobid on kõige kasutatavamad lamedate esemete, nt müntide, trükkplaatide või dokumentide, nt pangatähtede uurimisel, kuid neid saab suure teravussügavuse tõttu kasutada ka ebakorrapärase kujuga pindade, nt kiudude mõõtmisel.
USB microscopes are most useful when examining flat objects such as coins, printed circuit boards, or documents such as banknotes, but can be used on surfaces of irregular shape such as fibres owing to the high depth of field.