Alternatiivse splaissingu tulemusel moodustuvad erinevad mRNA-d, mis tagab väga erinevate eksonite arvuga transkriptide tekke. Selle protsessi tulemusel saadakse ühe geeni alusel valgu palju erinevaid isovorme (nt B-lümfotsüütide poolt toodetud väga spetsiifilised antikehad ehk immuunoglobuliinid).