Alfa-fetoproteiin esineb loote rebukoti rakkudes, gastrointestinaaltraktis ja maksas. Ta on levinuim loote plasmavalkudest, sarnaselt täiskasvanu albuminile. AFP geen paikneb inimese 4. kromosoomis (4q13.3). Glükoproteiinse AFP ja seerumalbumiini geenid lahknesid eellasgeeni duplikatsioonil juba 3-5 x 108 aastat tagasi.
