Geneetiliselt modifitseeritud tasakaalustatud kromosoomide (alalhoidjakromosoomide) eesmärk on pärssida homoloogilist rekombinatsiooni (ristsiire), et säilitada püsivalt homoloogses kromosoomis olevaid mutatsioone ja geene, vältides samas nende kadumist või laialivalgumist genoomis. Uuritavat mutatsiooni kandev kromosoom on alati heterosügootne tänu tasakaalustatud kromosoomile (alalhoidjakromosoomile).