See meetod võimaldab leida DNA piirkonnad, mis on kaitstud ensümaatilise lõikamise eest DNAaasiga. Meetod näitab DNA alad, mis on kaitstud degradatsiooni eest (nt DNA nukleosoomsed piirkonnad, DNA painde alad), sest need on valkude spetsiifilise seondumise piirkonnad DNA-le.