Cis-isomeeril asuvad ühesugused aatomid või aatomirühmad ühel pool kaksiksideme tasapinda, trans-isomeeril paiknevad ühel pool kaksiksideme tasapinda erinevad aatomid või aatomirühmad. Nähtust ennast nimetatakse cis-trans-isomeeriaks ehk geomeetriliseks isomeeriaks. Cis- ja transisomeerid erinevad nii füüsikalistelt kui keemilistelt omadustelt.
The two isomers are designated the cis isomer and the trans isomer when the two particular atomic groupings lie respectively on the same or on opposite sides of the reference plane.