Riikliku veterinaarjärelevalve põhiülesanneteks on: 1) järelevalve käesoleva seaduse ja teiste veterinaariaalaste õigusaktide nõuete täitmise üle; 2) loomade veterinaarabi, haiguste diagnostika, profülaktika, tõrje ja ravi korraldamine ning loomade tervise- ja loomakaitsealane järelevalve; 3) inimeste tervise kaitsmine inimestele ja loomadele ühiste haiguste eest ja nende haiguste tõrje; 4) laboratoorse uurimise korraldamine loomahaiguste diagnoosimiseks ja loomsete saaduste, loomasööda ning joogivee kvaliteedi hindamiseks; 5) loomade nakkushaiguste või loomadelt inimesele üle kanduvate nakkushaiguste teistest riikidest sissetoomise vältimiseks abinõude tarvituselevõtmine, samuti imporditavate loomade, loomsete saaduste, loomasööda ja võimalike nakkusekandjate veterinaarkontroll; 6) põllumajandusloomade ja lemmikloomade identifitseerimise ja registreerimise järelevalve, loomade ja loomsete saaduste siseriikliku liikumise veterinaarkontroll; 7) loomsete saaduste veterinaarkontroll ja nende nõuetekohasuse hindamine; 8) mitteloomsete toiduainete nõuetekohasuse ja ohutuse kontroll temale omistatud pädevuse piires; 9) söötade veterinaarkontroll; 10) loomakasvatushoonete, põllumajandusloomi ja loomseid saadusi töötlevate, transportivate ja säilitavate ettevõtete kontroll; 11) loomakasvatushoonete, põllumajandusloomi ja loomseid saadusi töötlevate ja säilitavate ettevõtete ehitus- ja rekonstrueerimisprojektide kooskõlastamine; 12) keskkonna kaitsmine loomapidamise ja loomahaigustega kaasnevate kahjulike tegurite eest; 13) veterinaararstide ja loomseid saadusi tootvate loomaomanike poolse ravimite ja ravimsöötade kasutamise kontroll; 14) Eestist loomi ja loomseid saadusi importiva riigi veterinaarnõuete täitmise kontroll.
