Paraku ilmnes aga tolliliidu kehtestamise tulemusena, et liikmesriigid ei loobu nii kergelt võimalusest oma riigi tootjaid kaitsta. Levima hakkasid nn mittetariifsed kaubandustõkked ehk nähtamatud kaubandusbarjäärid - kaupade omavahelist vaba liikumist takistasid rahvuslikud määrused, reeglid, maksud, mis asendasid tollimakse ja piirasid liikmesriikide vahelist kaubandust.
Pursuant to the Agreement on Agriculture concluded during the Uruguay Round Multilateral Trade Negotiations (4), the Community undertook to turn all variable agricultural levies and other non-tariff barriers into their tariff equivalent and to replace them by fixed customs duties from 1 July 1995.